Потапов Сергій Михайлович
Завідувач Київським Кабінетом науково-судової експертизи (січень 1914 р. – жовтень 1919 р.)
Доктор юридичних наук, професор.
Фаворський Василь Іванович
Завідувач Київським Кабінетом науково-судової експертизи – перший директор Київського інституту науково-судової експертизи (грудень 1919 р. – 1934 р.).
Вахліс Борис Йосифович
Директор Київського інституту науково-судової експертизи (травень 1937 р. – серпень 1939 р.).
Директор Київського науково-дослідного інституту судової експертизи (липень 1946 р. – лютий 1951 р.).
За його ініціативи видано перший збірник «Криміналістика і науково-судова експертиза».
Гетьман Тетяна Омелянівна
В.о. директора КНДІСЕ (грудень 1943 р. – вересень 1944 р.).
Сапожніков Юрій Сергійович
Директор КНДІСЕ (жовтень 1944 р. – липень 1946 р.).
Доктор медичних наук, професор.
Лисиченко Віталій Костянтинович
В.о. директора КНДІСЕ (лютий 1951 р. – червень 1951 р.).
Директор КНДІСЕ (червень 1951 – вересень 1962 р.).
Доктор юридичних наук, професор, Заслужений юрист України.
Сегай Михайло Якович
В.о. директора КНДІСЕ (жовтень 1962 р. – квітень 1963 р.).
В.о. директора КНДІСЕ (листопад 1979 р. – січень 1981 р.).
Доктор юридичних наук, професор, академік Національної академії правових наук України, заслужений діяч науки і техніки України.
Сапун Олександр Петрович
Директор КНДІСЕ (квітень 1963 р. – січень 1971 р.).
Кононенко Іван Пантелеймонович
Директор КНДІСЕ (січень 1971 р. – жовтень 1979 р.).
Стринжа Віктор Кирилович
Директор КНДІСЕ (січень 1981 р. – травень 1997 р.).
Заслужений юрист України, кандидат юридичних наук, доцент, член ради Спілки юристів України.
Круть Олександр Васильович
В.о. директора КНДІСЕ (травень 1997 р. – листопад 1997 р.)
Директор КНДІСЕ (листопад 1997 р. – грудень 2005 р.).
Кисельов Володимир Борисович
Директор КНДІСЕ (грудень 2005 – грудень 2010 р.).
Доктор технічних наук.
