Лабораторія криміналістичних видів досліджень:
- Відділ почеркознавчих досліджень
- Відділ технічних досліджень документів
- Відділ трасологічних, балістичних, вибухотехнічних досліджень та досліджень зброї
- Відділ досліджень матеріалів, речовин та виробів
- Відділ фоноскопічних, комп’ютерно-технічних досліджень
- Сектор лінгвістичних досліджень писемного мовлення
Лабораторія інженерно-технічних видів досліджень:
- Відділ досліджень будівельних робіт та визначення вартості нерухомого майна
- Відділ досліджень з питань експлуатації та користування нерухомого майна
- Відділ досліджень з питань землеустрою та оцінки земель
- Відділ досліджень з питань безпеки життєдіяльності, пожежно-технічних та електротехнічних досліджень
- Відділ інженерно-екологічних досліджень
- Відділ досліджень проектної документації та вартості будівельних робіт
- Відділ досліджень якості та вартості дорожньо-будівельних робіт
Лабораторія автотехнічних, товарознавчих та спеціальних видів досліджень:
- Відділ автотехнічних видів досліджень
- Відділ товарознавчих досліджень та досліджень об’єктів інтелектуальної власності
- Відділ транспортно-товарознавчих досліджень
- Сектор мистецтвознавчих досліджень
- Сектор товарознавчих досліджень військового майна, техніки та озброєння
Лабораторія економічних досліджень:
- Відділ досліджень бухгалтерського та податкового обліку і звітності
- Відділ досліджень фінансово-кредитних операцій та економічної діяльності підприємств
Лабораторія організації експертної діяльності:
- Відділ методичного забезпечення
- Відділ контролю та менеджменту якості досліджень
Лабораторія організації наукової, методичної діяльності, нормативного забезпечення та міжнародного співробітництва:
- Відділ наукової діяльності та міжнародного співробітництва
- Відділ нормативно-методичної діяльності та стандартизації
- Відділ нормативно-правового забезпечення